碳原子的结构最常见的有石墨结构和金刚石结构。
石墨为层结构，单层看的话，是C-C键形成正六边形的延展形状。而整体看的话，则是一层一层的结构。所以单层极为坚硬，而层与层之间极为柔软。
金刚石晶体的结构是碳原子的一种结晶体。其中的碳原子都以共价键结合，原子排列的基本规律是每6个碳原子组成一个环，就这样每2个环共用2个碳，无限延伸的。
自然产生的碳由三种同位素组成：12C和13C为稳定同位素，而14C则具放射性。其半衰期约为5,730年，是少数几个自远古就被发现的元素之一，是构成碳基生物的最基本元素。
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